技術(shù)平臺
化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在藥物靶點發(fā)現(xiàn)中迅速發(fā)展,尤其是基于化學(xué)探針的平臺。該技術(shù)已成功應(yīng)用于化學(xué)小分子藥物、天然產(chǎn)物、已批準老藥及內(nèi)源性代謝物。然而,開發(fā)化學(xué)探針面臨著諸如合成復(fù)雜、產(chǎn)率低、成本高及藥物分子SAR(Structure-Activity Relationship) 不明,這些因素極大地限制了靶點發(fā)現(xiàn)和機制解析。
基于光親和磁珠的藥物靶點發(fā)現(xiàn)平臺通過光照將活性藥物分子固定在功能性磁珠上,避免了化學(xué)探針的設(shè)計和合成,同時減少藥物結(jié)構(gòu)變化,保證藥物分子與靶點蛋白質(zhì)之間的特異性結(jié)合。固載有活性藥物分子的磁珠與蛋白質(zhì)組孵育后,可富集和分離藥物靶點蛋白質(zhì),用于免疫印記和質(zhì)譜分析。
平臺特點
案例展示
為驗證staurosporine(Stau)的靶點,我們將其固定于光親和修飾的功能性磁珠表面(以下簡稱Stau-beads)。隨后將Stau-beads與全蛋白質(zhì)組孵育,F(xiàn)moc-beads作為對照組。
所得WB結(jié)果如下圖所示,Stau-beads能有效富集目的蛋白FECH(已知陽性靶點)。
接下來,我們將Fmoc-beads和stau-beads富集分離的蛋白質(zhì)進行酶切,質(zhì)譜檢測,定量比較實驗組與對照組中蛋白質(zhì)的強度差異。結(jié)果表明,所有已知的陽性靶點蛋白質(zhì)均在Stau-beads組中被顯著性富集,證實了方法的有效性。