創(chuàng)新藥物靶點發(fā)現(xiàn)Innovative drug target discovery
背景介紹：
共價藥物，主要通過與靶點蛋白質(zhì)上的特定氨基酸殘基形成共價鍵來發(fā)揮作用，這些氨基酸殘基包括半胱氨酸，賴氨酸，絲氨酸等，阿司匹林為最早發(fā)現(xiàn)的共價藥物分子。此外，天然產(chǎn)物中也存在許多具有共價特性的代表性藥物，如具備抗炎生物活性的冬凌草素。近年來，共價靶向藥物逐漸受到藥物研發(fā)企業(yè)的廣泛關(guān)注。截至目前，已有至少6個針對激酶靶點的共價藥物獲得FDA批準上市，如針對BTK激酶的ibrutinib。
在細胞或組織中進行共價藥物的靶點發(fā)現(xiàn)時，一個有效的方法是對活性小分子進行化學改造，引入報告基團（如生物素、生物正交基團等）。在保留小分子原有活性的基礎(chǔ)上，這種改造使得我們能夠在活細胞或組織中直接捕獲與其相互作用的蛋白靶點。隨后，通過富集、酶解、質(zhì)譜鑒定和數(shù)據(jù)分析等步驟，可以獲得關(guān)于靶點的組學信息以及小分子作用的氨基酸位點信息。然而，實際操作中，許多活性分子不易進行化學改造，或者與氨基酸殘基反應后產(chǎn)生的產(chǎn)物不穩(wěn)定，導致無法適用于質(zhì)譜檢測。針對這類挑戰(zhàn)，科絡(luò)思生物提供了一種有效的解決策略——競爭性位點鑒定。
服務(wù)內(nèi)容：
技術(shù)平臺：
我們的技術(shù)平臺的核心在于一種通用型化學探針。當活性小分子與氨基酸殘基反應并占據(jù)該位點時，與空白對照樣本相比，這種通用型化學探針對該位點的標記會產(chǎn)生明顯的信號差異。通過讀取這部分標記信號的差異，我們能夠準確地獲得活性分子的靶點蛋白和氨基酸位點信息，包括預期的靶點（on-target）以及可能的非預期靶點（off-target）。這一技術(shù)平臺為共價藥物的靶點發(fā)現(xiàn)和藥物作用機制研究提供了有力支持。
實驗案例：
項目需求：AMG510由Amgen公司研發(fā)，是全球首款針對KRAS-G12C突變腫瘤的靶向藥物。本項目旨在驗證其在相應突變細胞中的靶點特異性和選擇性。采用科絡(luò)思生物DIA-ABPP平臺，全面篩查AMG510在細胞內(nèi)的共價靶點至氨基酸殘基級別。
數(shù)據(jù)展示：實驗數(shù)據(jù)顯示，在對NCI-H358細胞進行四次重復實驗中，系統(tǒng)分析了16992個來自5768個蛋白質(zhì)的半胱氨酸位點。1μM AMG510處理下，KRAS_C12位點顯著變化，而KRAS_C80不受影響，有力證明了AMG510對KRAS-G12C突變位點的高度特異性（標記的*表示目標半胱氨酸位點）。
