創(chuàng)新藥物靶點發(fā)現(xiàn)Innovative drug target discovery
背景介紹：
蛋白質(zhì)組學(xué)研究可根據(jù)其研究焦點是否特定于某類蛋白質(zhì)而劃分為靶向蛋白質(zhì)組學(xué)與非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)兩個分支。靶向蛋白質(zhì)組學(xué)分析是一種專注于特定蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)組的研究方法，通過選擇性地檢測和定量目標(biāo)蛋白質(zhì)，提供高靈敏度和高特異性的結(jié)果，用于深入研究蛋白質(zhì)功能和疾病機(jī)制。相較于非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)，靶向蛋白質(zhì)組學(xué)在準(zhǔn)確度、靈敏度和重現(xiàn)性方面均展現(xiàn)出更為優(yōu)越的性能，為蛋白質(zhì)組學(xué)的深入研究提供了更為精準(zhǔn)和可靠的工具。
此外，絕對定量分析是蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域中至關(guān)重要的技術(shù)手段，專門用于精確測定蛋白質(zhì)或肽段在樣本中的濃度或拷貝數(shù)。這一方法的核心在于利用已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品（通常為同位素標(biāo)記肽段）進(jìn)行精確校準(zhǔn)。絕對定量分析對于基礎(chǔ)生物學(xué)研究及臨床應(yīng)用具有重要意義，它不僅能夠提供更準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)表達(dá)信息，還有助于建立蛋白質(zhì)豐度數(shù)據(jù)庫，從而深化對生理過程和病理狀況下蛋白質(zhì)功能的理解。
技術(shù)優(yōu)勢：
① 專業(yè)技術(shù)優(yōu)勢：公司擁有先進(jìn)的質(zhì)譜平臺和資深專業(yè)團(tuán)隊，提供全面、精準(zhǔn)的非靶向與靶向蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)。
② 豐富服務(wù)選項：涵蓋多種靶向定量技術(shù)（PRM），滿足不同研究需求?？筛鶕?jù)客戶需求定制實驗方案，保障最優(yōu)實驗效果。
③ 嚴(yán)謹(jǐn)質(zhì)量管理：成熟質(zhì)量管理體系，遵循ISO9001標(biāo)準(zhǔn)，確保報告真實可信。
④ 從咨詢到報告交付，全程及時反饋進(jìn)度，確?？蛻舻臐M意度與項目的高效執(zhí)行。
服務(wù)內(nèi)容：
技術(shù)平臺：
科絡(luò)思生物提供基于質(zhì)譜技術(shù)的靶向與絕對定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)，旨在為客戶提供全面且深入的蛋白質(zhì)研究支持。
在靶向蛋白質(zhì)組學(xué)范疇內(nèi)，科絡(luò)思采用PRM（parallel reaction monitoring）作為核心技術(shù)手段。PRM能夠極其敏感地檢測到低豐度的多肽片段，有效排除背景蛋白干擾，并實現(xiàn)高精度定量，從而有效驗證和確認(rèn)非靶向蛋白質(zhì)組學(xué)所揭示的生物學(xué)差異相關(guān)蛋白質(zhì)。
與傳統(tǒng)的靶向蛋白質(zhì)定量方法（如Western blot）相比，靶向蛋白質(zhì)組學(xué)方法無需發(fā)展抗體，可一次性檢測多個蛋白，必要時可實現(xiàn)絕對定量。
案例展示：
項目需求：為了深入探究藥物處理組與對照組細(xì)胞樣品中，藥物與某些特定關(guān)注蛋白的結(jié)合位點，以揭示與藥物表型相關(guān)的分子機(jī)制。我們采用基于PRM技術(shù)的靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法，處理每組兩次生物學(xué)重復(fù)的樣本，實現(xiàn)對差異結(jié)合位點的精確鑒定和定量分析。
數(shù)據(jù)展示：塞利尼索（Selinexor, KPT330）通過共價結(jié)合抑制核蛋白輸出1（XPO1_C528_LVVVGAC*GVGK）活性從而治療多發(fā)性骨髓瘤和彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤。我們利用不同濃度KPT330處理HCT116細(xì)胞，采用高分辨質(zhì)譜技術(shù)，實現(xiàn)了對目標(biāo)母離子的全面、精確的二級質(zhì)譜信息捕獲。這種技術(shù)使得我們能夠選擇性地、精確地檢測目標(biāo)蛋白和肽段。發(fā)現(xiàn)在1 μM 條件下，KPT330對XOP1_C528位點占據(jù)率即可接近100%，并且通過擬合曲線發(fā)現(xiàn)，細(xì)胞內(nèi)位點結(jié)合能力EC50為241nM，與KPT330細(xì)胞抑制活性IC50（150-500nM）相當(dāng)。
