背景介紹:
在藥物研發(fā)領(lǐng)域,科學(xué)家們一直致力于針對(duì)特定疾病的創(chuàng)新療法探索。為深入理解疾病分子機(jī)制并識(shí)別有效的治療靶點(diǎn),為新型藥物的發(fā)現(xiàn)與開發(fā)提供關(guān)鍵線索和科學(xué)依據(jù),差異蛋白分析技術(shù)已成為關(guān)鍵工具。它助力科研人員系統(tǒng)地檢測(cè)蛋白質(zhì)表達(dá)變化,發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的靶蛋白,指導(dǎo)新藥開發(fā)和個(gè)性化治療策略的設(shè)計(jì)。
隨著高通量測(cè)序技術(shù)和質(zhì)譜技術(shù)等前沿科技的發(fā)展與應(yīng)用,差異蛋白分析的精確度和覆蓋范圍得以顯著提升,使得科研人員能夠在大規(guī)模數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上,對(duì)疾病進(jìn)程中潛在藥物靶點(diǎn)進(jìn)行深度挖掘和細(xì)致評(píng)估。因此,在現(xiàn)代生物醫(yī)藥研究中,差異蛋白分析不僅是解析疾病復(fù)雜生物學(xué)過程的關(guān)鍵途徑,也是推動(dòng)新藥研發(fā)進(jìn)程的重要引擎。
服務(wù)內(nèi)容:
疾病、藥物處理和環(huán)境刺激等條件引起的全蛋白質(zhì)組差異蛋白定量分析
亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)(細(xì)胞膜、細(xì)胞核、線粒體等)全蛋白質(zhì)組定量分析
全蛋白質(zhì)組水平生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)
技術(shù)平臺(tái):
科絡(luò)思生物提供標(biāo)準(zhǔn)化的樣品處理方案、蛋白質(zhì)組定性定量鑒定和專業(yè)的數(shù)據(jù)分析策略。
案例展示:
項(xiàng)目需求:為了對(duì)比藥物處理組與對(duì)照組細(xì)胞樣品在全蛋白質(zhì)組水平上的變化,以揭示與藥物表型相關(guān)的分子機(jī)制。我們對(duì)每組三次生物學(xué)重復(fù)的樣本運(yùn)用基于TMT技術(shù)的定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法,實(shí)現(xiàn)對(duì)差異表達(dá)蛋白的精確鑒定和定量分析。
數(shù)據(jù)展示:
1. 如蛋白豐度差異火山圖顯示,六組樣品中共同定量蛋白質(zhì)5987個(gè),對(duì)每個(gè)蛋白質(zhì)的比值進(jìn)行顯著性檢驗(yàn)分析,藥物處理組蛋白質(zhì)豐度上調(diào)為560個(gè),下調(diào)為363個(gè),相關(guān)強(qiáng)度信息也以熱圖形式展示。
2. 對(duì)差異蛋白質(zhì)進(jìn)行Gene_ontology 分析,包括GOTERM_ Biological process;GOTERM_ Cellular component;GOTERM_ Molecular function,KEGG_pathway,通過評(píng)判GO term富集程度的顯著性水平找到差異蛋白顯著富集的功能分類和通路,從而有助于藥物分子機(jī)制的判斷。
3. 以上圖為例,上調(diào)蛋白質(zhì)顯著富集在nuclear chromosome segregation,mitotic sister chromatid segregation,sister chromatid segregation等信號(hào)通路中,表明該藥物在分子水平上影響了核內(nèi)染色質(zhì)分離過程。